對配套設備設施建設欠考慮，同時存在使用目的性不明確。有些設備由于因沒有及時明確使用的目的性，就盲目進行政府采購，最后導致采購的產品不能滿足教學的需要，造成采購經費的浪費以及設備的無端閑置。

在實驗室建設中往往會疏忽或重復配套設備設施的采購計劃的申報。儀器設備采購部門分散，崗位設置不夠科學，采購人員隊伍建設薄弱。在2009年以前，采購部門分別有實驗設備處和資產財務處兩個職能部門。在此期間，特別是實驗設備處分管的教學儀器設備采購管理崗位上幾乎只有一人身兼多職，平時即要忙于繁重的采購工作，又要忙于瑣碎的儀器設備維修聯系、報廢、清查、相關業務數據分析統計及材料整理歸檔等工作，尤其在學院評估期間，工作更加繁重，造成只能重采購，輕管理的局面。

高職院校對儀器設備政府采購存在的其他問題。高職院校對政府采購認識不足，對采購管理部門建設重視力度不夠。一是由于政府采購制度在我院實施時間不長，一些部門長期以來的習慣很難一下改變，對政府采購工作缺少正確認識，對政府采購法學習、宣傳不夠，申報材料不詳細，不規范，配合力度不夠；二是對采購管理部門建設重視力度不夠，忽略了政府采購是一項需要具備各方面專業技術人員才能完成的工作。