三峽工程建設運行情況良好，三峽電站機組運行安全穩定，升船機等后續工程建設有序推進，防洪、抗旱、航運、發電、補水等綜合效益顯著發揮。

2013年，三峽水庫累計來水3678億立方米，較2012年（4481億立方米）偏枯17.9%，較多年平均值（4510億立方米）偏枯18.4%.三峽水庫累計為下游補水146天，補水量210.5億立方米。消落期間，日均補水量1410立方米每秒。2013年6月10日，三峽水庫消落至防洪汛限水位，全面啟動2013年防洪度汛工作。汛期實施防洪調度5次，最大削峰14000立方米每秒，削峰率28.6%，累計攔蓄洪水總量118.37億立方米。通過三峽水庫攔洪錯峰的作用，控制最大出庫流量35000立方米每秒，下游沙市站和城陵磯站水位沒有超過警戒水位；實施船舶疏散調度兩次，利用洪水間隙，適時調整三峽出庫流量，及時疏散洪水期間積壓的中小船舶360艘。2013年11月11日，三峽水庫第四次成功蓄水至175米水位。監測數據顯示，三峽水庫消落及蓄水過程中，庫區沿岸未發生較大地質災害及水華現象。

2013年，三峽船閘共運行10770閘次，通過船舶4.6萬艘次，旅客43.2萬人次，貨物9707萬噸（上行6029萬噸），運行閘次數及上行貨運量均創歷史新高。3月，僅用20天時間完成北線五級船閘的檢修任務，突破了大型船閘檢修的傳統模式，圓滿完成了歲修工作，恢復和提高了設備設施的技術性能及可靠性，對確保船閘的安全高效運行，充分發揮三峽工程航運效益具有重要意義。

2013年汛期，為充分利用洪水資源，提高電站發電效益，共開展5次小洪水優化調度，累計增發電量49.2億千瓦時，其中三峽電站46.98億千瓦時，葛洲壩電站2.22億千瓦時。截至2013年12月31日，三峽電站連續安全運行2693天，累計發電量達到7119.7億千瓦時，相當于減排二氧化碳5.61億噸，減排二氧化硫673萬噸。隨著電站機組的全面投產，三峽電站成為世界上裝機容量最大的水電站和我國重要的清潔能源基地。

2013年，升船機建設和壩區規劃項目穩步推進。升船機土建工程基本完成，齒條、螺母柱及二期埋件安裝順利，船廂結構拼裝有序進行；三峽壩區各規劃項目進展順利，多次組織專題研討并采取有效措施，長江珍稀魚類保育中心、三峽國際水電中心等重大項目陸續開工；各項工程建設質量、安全、進度、成本、環保等要素控制到位。