科學儀器的出口總額雖然可喜，但是對比另外一個數字，我們就不會如此樂觀了。據相關專業人士所提供的數據，中國科學儀器行業雖然出口強勁，但是進口總額更大，進出口逆差已超百億美元，且這種逆差呈現逐漸拉大的趨勢。而根據最近的相關報道，中國儀器儀表行業協會秘書長閆增序稱儀器儀表行業6月出口額同比出現負增長，今年儀器儀表行業利潤增幅是否能達到預期的14%不能確認。

來自中國儀器儀表學會對中國科學儀器產業發展狀況所做的專題調研結果顯示，2010年，中國科學儀器類出口呈現強勁的復蘇勢頭，達到63.41億美元，但是該行業進口總額更大，達到157.3億美元，進出口逆差達到93.9億美元。到了2011年，科學儀器出口達71.02億美元，增長12.0%；進口則依然保持強勁態勢，達207.48億美元，進出口逆差首次突破百億美元大關，達到136.46億美元。

有數據顯示，目前，中國科學儀器生產廠家有1000多家，大部分產值都低于1000萬元；分析儀器廠家達200多家，產值上億元的卻不多。相關業內人士談到：為求生存，企業在激烈的市場競爭中競相壓價，減少了利潤空間，降低了研發投入的能力，導致整個科學儀器市場發展呈現疲軟態勢。

對于目前市場上的這個狀況，不得不另業內人士擔憂，如何使國內的儀器儀表行業走向良性發展之路，快速的縮短與國際領先水平的差距，則是業內人士應該共同去考慮的。