近年來，我國電力行業積極轉變發展方式、調整電源結構，堅持走清潔、綠色、低碳發展之路，為社會經濟發展和生態文明建設作出了重要貢獻。雖然在清潔、綠色、低碳發展方面取得了較好成績，但與國家對電力企業的環保要求相比，還有較大差距，清潔發展之路仍面臨艱巨的任務和挑戰。目前遇到的困難和問題主要有以下五個方面：

一是清潔發展理念還沒有真正根深蒂固。受長期計劃經濟、粗放發展模式影響，部分電力企業的思維模式還沒有真正從規模思維中走出來，對內涵式發展、核心競爭力培育、做好做優還重視不夠。

二是節能環保資金缺乏，清潔發展戰略實施受到制約。受“市場煤，計劃電”影響，五大發電集團火電板塊連虧4年，累計虧損達921億元。因此，在環保設施、節能技改等前期投入方面缺乏資金投入和保障，清潔發展戰略的實施受到較大影響。

三是電力企業承受能力有限。國家對火電污染物排放的控制力度日益加大，脫硫、脫硝、除塵等一系列設備改造及運行維護費用高昂，導致企業成本增加，負擔加重，短期內無法彌補。

四是新能源發展遇到瓶頸，相關改革配套措施沒有到位。國家支持新能源發展的利好政策，在刺激新能源井噴式發展的同時，也帶來了新的問題。首先，發展太快，市場過剩。2008年新能源發展剛剛起步時，由于數量少，政策支持力度大，經歷了三年多的發展“黃金期”，從2012年開始，新能源發電市場已經飽和甚至過剩，比較典型的如風電、光伏發電等產業，在經過快速擴張后，造成較為嚴重的低端同質化競爭后果，整個行業面臨重新洗牌。另外，受制因素多，效益未達預期。例如水電受移民、環保因素影響造價暴漲；核電安全性受質疑，難獲資質，發展受阻；太陽能熱發電核心技術未成熟，發電成本高昂等。其次，相關制度措施沒有到位。

新能源發展缺乏通盤考慮和整體規劃，產業規模化、標準化方面還有很長的路要走。

五是科技研發投入不足，節能環保核心技術水平偏低。與發達國家相比，我國電力科技水平仍存在較大差距，科技研發重視不夠、投入不足，自主創新的基礎比較薄弱，核心和關鍵技術落后于世界先進水平，重要設備的國產化率低，一些關鍵技術和裝備，如航改型燃機、大型清潔高效發電設備、多晶硅、頁巖氣勘探開發技術、先進核反應堆技術等依賴于國外引進，增加了綠色環保成本。